PDF и EPS собираются как чистый вектор: каждый модуль QR — отдельный прямоугольник или окружность, никакого растра. В режиме CMYK заливка записана оператором DeviceCMYK с вашими значениями — при выводе плёнок и форм ничего не пересчитывается из RGB. В режиме PANTONE цвет оформлен как плашечная краска: в PDF это цветовое пространство Separation с именем цвета и CMYK-подменой, в EPS — custom color с комментариями DocumentCustomColors, поэтому в Adobe Illustrator, InDesign и на RIP цвет появится в списке красок отдельной позицией.
Размер задаётся в миллиметрах и записывается в геометрию файла точно: страница PDF и BoundingBox EPS равны выбранному размеру. Тихая зона входит в этот размер. Перед сдачей в печать проверьте код камерой с экрана и попросите типографию сделать контрольный вывод: сканируемость финального оттиска зависит от материала, растискивания и цвета краски.